Soutenance de thèse :

Circuits biologiques distribués dans les systèmes phages-bactéries synthétiques

À mesure que la taille et la complexité des circuits génétiques synthétiques augmentent, ils deviennent progressivement trop lourds pour une seule cellule. En revanche, les systèmes naturels sont capables de coder des programmes de très grande taille en utilisant des mécanismes de régulation complexes pour maîtriser les coûts d’expression. Ils y parviennent en combinant la régulation de l’expression génétique et la distribution des fonctions dans plusieurs cellules.

Ce projet étudie comment des circuits génétiques synthétiques peuvent être distribués dans un consortium de cellules bactériennes qui communiquent entre elles. Nous concevons, construisons et testons des communications intercellulaires synthétiques dans des systèmes de cultures mixtes microbiologiques (avec des cultures mixtes bactéries-phages) qui peuvent être utilisés pour mettre en œuvre des portes logiques biologiques distribuées.

Nous nous attendons à ce que les résultats de ce travail permettent non seulement la mise à l’échelle de circuits génétiques synthétiques, mais améliorent également notre compréhension de la division du travail dans les communautés microbiennes ou les organismes multicellulaires.

Jury members:

• Mme Mirielle ANSALDI, Directrice de Recherche, CNRS, Aix-Marseille Université – Rapporteure
• Mr Clément NIZAK, Directeur de Recherche, Laboratoire Jean Perrin, CNRS, Sorbonne Université – Rapporteur
• Mme Yolanda SCHAERLI, Directrice de Recherche, Université de Lausanne – Examinatrice
• Mme Valérie PEZO, Directrice de Recherche, Institut F. Jacob, CEA, Université Paris-Saclay – Examinatrice
• Mr Angel GOÑI-MORENO, Directeur de Recherche, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC Madrid – Membre invité

Directed by:

Jean-Loup FAULON (Directeur de recherche, Institut Micalis, INRAE) et Manish KUSHWAHA (Directeur de recherche, Institut Micalis, INRAE).