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Galaxy
SynBioCAD

Conception et ingénierie de la biologie synthétique dans la galaxie

Galaxy SynBioCAD est un environnement de travail Galaxy en libre accès qui permet de concevoir et de construire différentes voies métaboliques pour la production d’un composé d’intérêt. Galaxy-SynBioCAD combine l’efficacité éprouvée de RetroPath2.0 et un générateur de scripts automatisé pour piloter des stations de travail robotisées pour l’assemblage de vecteurs et la transformation de souches.

Joan Hérisson

Operational manager

Jean-Loup Faulon

Scientific manager

Galaxy SynBioCAD est un environnement de travail Galaxy en libre accès qui permet de concevoir et de construire différentes voies métaboliques pour la production d’un composé d’intérêt. Galaxy-SynBioCAD comprend :

  1. un logiciel de rétrosynthèse open-source basé sur des règles de réaction généralisées qui génère des réseaux reliant le(s) composé(s) cible(s) aux métabolites de la souche châssis,
  2. une méthode d’analyse en aval avec analyse des flux,
  3. la conception d’expériences pour déterminer les parties d’ADN à assembler pour construire des bibliothèques de voies,
  4. le générateur de scripts automatisés pour piloter des stations de travail robotisées pour l’assemblage des vecteurs et la transformation des souches.

La plateforme intuitive et conviviale du portail Galaxy SynBioCAD

Membres de l'équipe

Joan HERISSON

Jean-Loup FAULON

Thomas DUIGOU