Chercheur à INRAE de Jouy-en-Josas depuis 25 ans. Ses recherches ont d’abord porté sur le microbiote intestinal humain en relation avec l’alimentation et la santé dans l’équipe de Joël Doré (1999-2004), puis sur les déterminants génétiques clés dans la transition du commensalisme à la pathogénie opportuniste de Enterococcus faecalis dans l’équipe de Pascale Serror (depuis 2005). Ses travaux actuels ont fait se rejoindre ces 2 thématiques et sont consacrés à l’effet barrière du microbiote intestinal contre les bactéries multirésistantes dont Enterococcus, dans le but de mieux comprendre le mécanisme de cet effet barrière, et de traduire ces connaissances en applications pour la médecine personnalisée chez l’homme. Dans ce cadre, il est le responsable scientifique du plateau Cultissimeo pour le development de la culturomique à haut debit et coordinateur du projet ciblé Cultissimo dans le PEPR Système Alimentaire Microbiome et Santé.
